More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2178 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2261  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2178  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0654  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1975  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0150258  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0660  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1614  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0766  DNA-binding response regulator  96.79 
 
 		 249 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  61.61 
 
 		 249 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5869  two component transcriptional regulator  56.07 
 
 		 261 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5652  two component transcriptional regulator  55.6 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0393139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.89 
 
 		 235 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  32.89 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 230 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.8 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  35.27 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  36.89 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  32.44 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  32 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 230 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.22 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  34.35 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 235 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 229 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  32.3 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  30.8 
 
 		 225 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.86 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 224 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.34 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  30.28 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  32 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  32 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>