48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1470 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  400  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  91.2 
 
 
216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  91.2 
 
 
216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  91.2 
 
 
216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  91.2 
 
 
216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  90.74 
 
 
216 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  90.74 
 
 
216 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  90.28 
 
 
216 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  61.75 
 
 
246 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  63.13 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  63.13 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  63.13 
 
 
223 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  62.21 
 
 
223 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  62.21 
 
 
223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  60.09 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  44.69 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  43.81 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  42.62 
 
 
254 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  42.08 
 
 
254 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  43.03 
 
 
253 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  41.52 
 
 
261 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  42.22 
 
 
232 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  43.53 
 
 
215 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  43.6 
 
 
252 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  43.6 
 
 
252 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  45.86 
 
 
244 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  30.51 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.24 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  42.6 
 
 
626 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.7 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  34.85 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  35.35 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  33.53 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  39.55 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  34.56 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  38.42 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  35.98 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  36.14 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  37.26 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  38.04 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  37.21 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  34.18 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  37.41 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  32.91 
 
 
245 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  34.3 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  35.9 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  39.52 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  34.41 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>