31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0521 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  36.54 
 
 
998 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  29.35 
 
 
971 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  53.41 
 
 
925 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  53.75 
 
 
796 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  48.39 
 
 
815 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  47.37 
 
 
784 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  46.81 
 
 
768 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  44.44 
 
 
786 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  50.62 
 
 
796 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  50.57 
 
 
785 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  52.33 
 
 
813 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  52.33 
 
 
813 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  53.75 
 
 
778 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  46.46 
 
 
154 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  25.57 
 
 
920 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  48.84 
 
 
799 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  46.74 
 
 
809 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  46.74 
 
 
809 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  50 
 
 
795 aa  93.2  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  48.28 
 
 
794 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  45.16 
 
 
788 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  45.45 
 
 
455 aa  65.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  35.9 
 
 
479 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  35.9 
 
 
479 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  35.9 
 
 
479 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  35.9 
 
 
479 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  35.9 
 
 
485 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  35.9 
 
 
485 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  36.84 
 
 
463 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  25.2 
 
 
1041 aa  45.4  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>