51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5478 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5478  putative UV damage endonuclease  100 
 
 
317 aa  660    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5525  putative UV damage endonuclease  97.48 
 
 
325 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5482  putative UV damage endonuclease  92.11 
 
 
317 aa  618  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00076695  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5196  putative UV damage endonuclease  96.21 
 
 
325 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5031  putative UV damage endonuclease  95.9 
 
 
317 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5440  putative UV damage endonuclease  95.9 
 
 
325 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5047  putative UV damage endonuclease  96.53 
 
 
325 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.43469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5592  putative UV damage endonuclease  95.9 
 
 
325 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5145  putative UV damage endonuclease  88.96 
 
 
317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5470  putative UV damage endonuclease  91.8 
 
 
317 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000392021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0352  putative UV damage endonuclease  42.95 
 
 
320 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1958  putative UV damage endonuclease  43.04 
 
 
321 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09690  UV-damage endonuclease  38.67 
 
 
309 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0263  putative UV damage endonuclease  38.05 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5061  putative UV damage endonuclease  37.42 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0261  putative UV damage endonuclease  36.91 
 
 
320 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0220  putative UV damage endonuclease  36.91 
 
 
320 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0226  putative UV damage endonuclease  36.59 
 
 
320 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0222  putative UV damage endonuclease  36.59 
 
 
320 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0268  putative UV damage endonuclease  36.28 
 
 
320 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0248  putative UV damage endonuclease  36.59 
 
 
320 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0234  putative UV damage endonuclease  36.59 
 
 
320 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0282  putative UV damage endonuclease  36.28 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1722  putative UV damage endonuclease  30.41 
 
 
301 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1346  putative UV damage endonuclease  35.99 
 
 
306 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1549  UV-endonuclease UvdE  29.17 
 
 
418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2329  putative UV damage endonuclease  31.96 
 
 
412 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.385133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3012  UV-endonuclease UvdE  30.84 
 
 
420 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.295167 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2043  putative UV damage endonuclease  31.65 
 
 
412 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0174  putative UV damage endonuclease  30.45 
 
 
296 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2424  UV-endonuclease UvdE  31.05 
 
 
353 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03600  conserved hypothetical protein  31.56 
 
 
612 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.574638  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2026  UV-endonuclease UvdE  31.54 
 
 
311 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200241  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1671  putative UV damage endonuclease  26.62 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00771336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0136  putative UV damage endonuclease  32.26 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00604  endonuclease (Eurofung)  30.22 
 
 
591 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0573  putative UV damage endonuclease  32.02 
 
 
315 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280192  normal  0.431721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3025  putative UV damage endonuclease  29.41 
 
 
298 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4123  putative UV damage endonuclease  30.64 
 
 
308 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2305  UV-endonuclease UvdE  28.57 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1819  putative UV damage endonuclease  31.71 
 
 
311 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.594158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1816  UV damage repair endonuclease  28.1 
 
 
364 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1536  UV damage repair endonuclease  28.1 
 
 
364 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2133  UV damage repair endonuclease  26.04 
 
 
357 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  0.466844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1707  UV damage repair endonuclease  28.1 
 
 
363 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0239219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6817  UV damage repair endonuclease  25.15 
 
 
355 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1694  UV damage repair endonuclease-like protein  25.88 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0383  UV damage repair endonuclease-like protein  25.36 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0127865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2319  UV damage repair endonuclease-like protein  22.83 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3654  UV damage repair endonuclease-like protein  28.31 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000592118  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1775  hypothetical protein  32.39 
 
 
57 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000133943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>