33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7236 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  56.25 
 
 		 184 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  42.86 
 
 		 224 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  41.79 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  43.31 
 
 		 220 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  40.78 
 
 		 214 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  34.13 
 
 		 259 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1493  hypothetical protein  35.61 
 
 		 311 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94196  normal  0.479345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  32.41 
 
 		 281 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  30.15 
 
 		 589 aa  84  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  37.37 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  31.03 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  40.86 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  30.34 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  31.72 
 
 		 312 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  31.72 
 
 		 312 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  31.82 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  31.03 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  33.33 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  32.05 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  28.18 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  48.94 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  34.62 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  49.09 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  43.4 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  41.82 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1654  SH3 type 3 domain-containing protein  26.92 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  27.59 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  35.85 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>