35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7066 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  60.41 
 
 
197 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
193 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 
206 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  48.99 
 
 
200 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  48.19 
 
 
198 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  42.21 
 
 
208 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  39.41 
 
 
477 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  38.29 
 
 
191 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  37.5 
 
 
173 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  36.88 
 
 
173 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
173 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  39.79 
 
 
196 aa  101  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  35.5 
 
 
186 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
171 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  34.59 
 
 
186 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  33.33 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  85.5  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  31.39 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  33.33 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
289 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1743  acetyltransferase, GNAT family  35 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2234  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  34.72 
 
 
314 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.406017 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2190  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
180 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>