More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5178 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5178  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.075348  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3861  response regulator receiver protein  88.05 
 
 		 181 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3108  response regulator receiver domain-containing protein  88.27 
 
 		 182 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1662  response regulator receiver domain-containing protein  87.5 
 
 		 181 aa  294  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.726285  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1334  response regulator receiver  85.62 
 
 		 181 aa  289  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3241  response regulator receiver  81.13 
 
 		 181 aa  277  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0160645  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2189  response regulator receiver domain-containing protein  80.75 
 
 		 181 aa  273  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.029614  normal  0.118925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0951  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3963  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1223  response regulator receiver protein  48.94 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3038  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.815906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2156  response regulator receiver protein  43.45 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2214  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2212  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1517  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3155  response regulator receiver protein  37.69 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0143  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.580562  normal  0.150603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2973  response regulator receiver  36.92 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal  0.568841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3199  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0658  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0528  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0423  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0734879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 129 aa  84  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  40.37 
 
 		 128 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0286  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 194 aa  84  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  40.57 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  41.12 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3298  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  40.19 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  37.74 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.68 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  39.09 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4312  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  38.68 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  35.85 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  36.79 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  34.91 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  38.68 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  35.85 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  35.85 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  36.79 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  38.68 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3115  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0525  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.545244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  37.74 
 
 		 129 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0661  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  37.38 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>