30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4338 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1457    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2117  glycosyltransferase TibC  53.72 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0750  hypothetical protein  53.42 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1664  hypothetical protein  53.42 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0708  hypothetical protein  53.42 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0598  hypothetical protein  53.42 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2019  hypothetical protein  53.91 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14477  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0526  hypothetical protein  53.91 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0876  hypothetical protein  52.63 
 
 		 423 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.504202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  33.18 
 
 		 1087 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1082 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  24.59 
 
 		 1611 aa  80.9  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 817 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1123 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 567 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.54 
 
 		 732 aa  54.3  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  27.36 
 
 		 539 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.99 
 
 		 390 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.99 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.99 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.99 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.99 
 
 		 390 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.57 
 
 		 390 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  28.89 
 
 		 343 aa  48.5  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.26 
 
 		 394 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1100  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  27.85 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000330109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  30.66 
 
 		 349 aa  44.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.99 
 
 		 458 aa  44.3  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>