More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4188 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1180  isocitrate lyase  70.75 
 
 		 534 aa  800    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2234  isocitrate lyase  73.53 
 
 		 527 aa  838    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0305365  decreased coverage  0.0000429136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28420  isocitrate lyase  76.56 
 
 		 531 aa  867    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.528136  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0304  isocitrate lyase  67.62 
 
 		 531 aa  772    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1232  isocitrate lyase  72.26 
 
 		 527 aa  811    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4801  isocitrate lyase  77.88 
 
 		 528 aa  855    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.815542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4447  isocitrate lyase  77.13 
 
 		 527 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2353  isocitrate lyase  72.78 
 
 		 527 aa  826    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000102131  decreased coverage  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4188  isocitrate lyase  100 
 
 		 545 aa  1142    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0755941  normal  0.12145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2573  isocitrate lyase  76.94 
 
 		 531 aa  868    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157334  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1627  isocitrate lyase  63.76 
 
 		 528 aa  725    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0542  isocitrate lyase  77.88 
 
 		 528 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0384  isocitrate lyase  77.17 
 
 		 528 aa  852    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5860  isocitrate lyase  77.13 
 
 		 527 aa  854    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0317025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0047  isocitrate lyase  81.63 
 
 		 530 aa  917    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1448  isocitrate lyase  62.69 
 
 		 527 aa  718    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397678  normal  0.373019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0610  isocitrate lyase  77.13 
 
 		 527 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1090  isocitrate lyase  81.18 
 
 		 531 aa  895    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.198066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01326  isocitrate lyase  71.04 
 
 		 531 aa  780    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.190818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2926  isocitrate lyase  80.15 
 
 		 531 aa  904    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.70995  normal  0.314009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4878  isocitrate lyase  88.1 
 
 		 544 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4199  isocitrate lyase  89.15 
 
 		 545 aa  1027    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1029  isocitrate lyase  79.16 
 
 		 531 aa  884    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1379  isocitrate lyase  88.42 
 
 		 545 aa  1017    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3724  isocitrate lyase  77.88 
 
 		 528 aa  855    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4053  isocitrate lyase  88.99 
 
 		 545 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12313  isocitrate lyase  64.65 
 
 		 552 aa  730    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1860  isocitrate lyase  63.76 
 
 		 528 aa  726    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3465  isocitrate lyase  73.43 
 
 		 530 aa  825    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4737  isocitrate lyase  76.75 
 
 		 526 aa  852    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613526  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0529  isocitrate lyase  77.88 
 
 		 528 aa  858    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0943  isocitrate lyase  79.73 
 
 		 530 aa  894    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.478615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3921  isocitrate lyase  77.13 
 
 		 527 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1215  isocitrate lyase  70.38 
 
 		 533 aa  803    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2407  isocitrate lyase  75.43 
 
 		 531 aa  853    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210555  normal  0.138791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3157  isocitrate lyase  84.34 
 
 		 542 aa  948    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2041  isocitrate lyase  71.83 
 
 		 527 aa  825    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2682  isocitrate lyase  71.32 
 
 		 531 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000577171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3139  isocitrate lyase  72.87 
 
 		 526 aa  824    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4340  isocitrate lyase  77.74 
 
 		 528 aa  857    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3879  isocitrate lyase  77.36 
 
 		 528 aa  853    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51448  normal  0.0498655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30050  isocitrate lyase  76.56 
 
 		 531 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1363  isocitrate lyase  58.45 
 
 		 535 aa  592  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1501  isocitrate lyase  28.93 
 
 		 461 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0665  isocitrate lyase  27.5 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000467053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2380  isocitrate lyase  28.32 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.399534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2249  isocitrate lyase  28.2 
 
 		 428 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.44014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0583  isocitrate lyase  26.76 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3098  isocitrate lyase  27.72 
 
 		 432 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1368  isocitrate lyase  28.31 
 
 		 434 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871931  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1102  isocitrate lyase  28.27 
 
 		 438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1651  isocitrate lyase  28.31 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232298  normal  0.0282677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1865  isocitrate lyase  28.8 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0028  isocitrate lyase  28.06 
 
 		 427 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1506  isocitrate lyase  26.39 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2486  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203517  hitchhiker  0.000410073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1950  isocitrate lyase  27.71 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8838  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1335  isocitrate lyase  26.83 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1229  isocitrate lyase  28.31 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.19821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1415  isocitrate lyase  26.51 
 
 		 441 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1869  isocitrate lyase  26.74 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.612764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1739  isocitrate lyase  27.83 
 
 		 426 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2080  isocitrate lyase  27.71 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.250902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01042  isocitrate lyase  28.43 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1998  isocitrate lyase  28.11 
 
 		 435 aa  143  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0768  isocitrate lyase  28.01 
 
 		 431 aa  143  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.139053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2088  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00747543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1097  isocitrate lyase  27.7 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3224  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4054  isocitrate lyase  28.83 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1361  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2470  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1586  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0742206  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2613  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5357  isocitrate lyase  27.51 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2524  isocitrate lyase  27.91 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1480  isocitrate lyase  27.35 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1385  isocitrate lyase  27.59 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2067  isocitrate lyase  28.11 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2985  isocitrate lyase  29.28 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.54257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6029  isocitrate lyase  28.11 
 
 		 435 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2048  isocitrate lyase  28.11 
 
 		 435 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1429  isocitrate lyase  27.2 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0592  isocitrate lyase  30.4 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442111  normal  0.573655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2101  isocitrate lyase  26.57 
 
 		 439 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0829587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0854  isocitrate lyase  27.87 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00269898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004371  isocitrate lyase  28.43 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1052  isocitrate lyase  27.15 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1287  isocitrate lyase  27.15 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000193732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1030  isocitrate lyase  27.15 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1132  isocitrate lyase  27.15 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00988678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1210  isocitrate lyase  27.15 
 
 		 425 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1017  isocitrate lyase  28.77 
 
 		 430 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2855  isocitrate lyase  27.36 
 
 		 439 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1358  isocitrate lyase  27.79 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.355427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1484  isocitrate lyase  27.38 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0711  isocitrate lyase  26.41 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1246  isocitrate lyase  28.1 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0481368  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02080  isocitrate lyase  28.03 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1229  isocitrate lyase  26.95 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>