More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3580 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  100 
 
 
350 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  73.41 
 
 
357 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  68.5 
 
 
357 aa  488  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  65.99 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  65.13 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  63.51 
 
 
357 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  61.78 
 
 
357 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.49 
 
 
353 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.39 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50 
 
 
350 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  47.62 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4242  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  50.15 
 
 
356 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.79779  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
346 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  43.1 
 
 
347 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
417 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.69 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.34 
 
 
360 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.22 
 
 
345 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.45 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.83 
 
 
345 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.35 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.54 
 
 
345 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.99 
 
 
370 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  44.54 
 
 
345 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.23 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
335 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44 
 
 
343 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.21 
 
 
354 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 
355 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  43.97 
 
 
343 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  39.12 
 
 
352 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  38.94 
 
 
352 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.01 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.32 
 
 
360 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.72 
 
 
351 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.24 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.11 
 
 
334 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.34 
 
 
379 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.04 
 
 
356 aa  237  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
353 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.43 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.95 
 
 
350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.84 
 
 
351 aa  235  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.13 
 
 
351 aa  235  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.43 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.43 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.13 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.71 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.18 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.63 
 
 
350 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.55 
 
 
351 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.94 
 
 
368 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.97 
 
 
347 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.44 
 
 
356 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.44 
 
 
355 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  38.14 
 
 
357 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.69 
 
 
383 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
357 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.08 
 
 
359 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.52 
 
 
349 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6082  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.52 
 
 
335 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.54 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.06 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.25 
 
 
349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
356 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
354 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 
356 aa  215  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.39 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.87 
 
 
351 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.33 
 
 
395 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2431  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.85 
 
 
394 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.843563  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 
365 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
350 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.04 
 
 
414 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
370 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 
444 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.03 
 
 
386 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3378  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.59 
 
 
363 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
391 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
383 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
331 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.74 
 
 
369 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.31 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1504  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.83 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.643881 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.37 
 
 
376 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
383 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
383 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 
390 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.04 
 
 
359 aa  199  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  38.28 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.49 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
369 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
363 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 
358 aa  195  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1252  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.95 
 
 
363 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0971666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2006  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.24 
 
 
375 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.361221  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
372 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>