More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3573 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  82.66 
 
 		 518 aa  891    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3573  putative methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  100 
 
 		 519 aa  1059    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  83.24 
 
 		 519 aa  884    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3891  propionyl-CoA carboxylase  57.14 
 
 		 533 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3419  Propionyl-CoA carboxylase  57.12 
 
 		 515 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1099  propionyl-CoA carboxylase  57.7 
 
 		 515 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0831  propionyl-CoA carboxylase  56.51 
 
 		 514 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  54.76 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  54.37 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1979  propionyl-CoA carboxylase  46.45 
 
 		 518 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  33.91 
 
 		 531 aa  286  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  35.06 
 
 		 516 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  35.12 
 
 		 508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 531 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  35.36 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  35.36 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  35.36 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  32.75 
 
 		 516 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  35.69 
 
 		 538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  32.61 
 
 		 515 aa  270  7e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  35.46 
 
 		 516 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  35.02 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  33.6 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  32.86 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  32.74 
 
 		 516 aa  266  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  33.94 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  32.82 
 
 		 517 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  34.41 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  34.82 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  35.17 
 
 		 510 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  32.44 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  31.98 
 
 		 528 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  34.68 
 
 		 514 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  32.44 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  32.6 
 
 		 508 aa  261  3e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  32.24 
 
 		 514 aa  260  3e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  33.81 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  32.38 
 
 		 520 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  31.49 
 
 		 516 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  35.98 
 
 		 519 aa  259  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  33.07 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  33.73 
 
 		 514 aa  257  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  32.69 
 
 		 519 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  32.18 
 
 		 516 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  33.07 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  33.06 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  32.79 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  31.65 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  33.4 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  32.88 
 
 		 519 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  34.07 
 
 		 516 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3618  carboxyl transferase  34.15 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  32.3 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  33.07 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  32.59 
 
 		 510 aa  253  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  33.2 
 
 		 510 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  31.11 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2974  carboxyl transferase  32.59 
 
 		 515 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  33.6 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  33 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  33.13 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0718  carboxyl transferase  34.43 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.267542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  30.92 
 
 		 516 aa  250  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  33.67 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  33.6 
 
 		 510 aa  250  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  32.75 
 
 		 515 aa  250  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  31.99 
 
 		 523 aa  249  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  32.67 
 
 		 514 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  32.55 
 
 		 514 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  31.08 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  32.94 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  31.36 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.89 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  33.02 
 
 		 527 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  31.93 
 
 		 510 aa  248  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2082  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.0739179 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 510 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  32.44 
 
 		 521 aa  246  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  33.79 
 
 		 498 aa  246  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  32.8 
 
 		 510 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  32.59 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  34.38 
 
 		 513 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  32.94 
 
 		 510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  32.54 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  33.06 
 
 		 513 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  31.25 
 
 		 512 aa  243  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  30.77 
 
 		 518 aa  243  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  32.59 
 
 		 510 aa  242  9e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  31.66 
 
 		 513 aa  243  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  32.67 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  30.6 
 
 		 512 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  33.54 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  32.79 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  31.91 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>