217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2383 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  59.71 
 
 		 257 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  61.27 
 
 		 254 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  58.45 
 
 		 259 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  56.52 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  59.51 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  57.56 
 
 		 257 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  42.69 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  43.27 
 
 		 256 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  46.93 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  41.83 
 
 		 254 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  41.48 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  45.16 
 
 		 254 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  44.85 
 
 		 244 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  43.9 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  48.5 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  47.37 
 
 		 254 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  47.59 
 
 		 241 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  42.26 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  41.85 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  41.75 
 
 		 243 aa  141  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  38.54 
 
 		 259 aa  140  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  44.07 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  41.67 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  40.56 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  41.24 
 
 		 255 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  41.18 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  39.18 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  37.43 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  37.79 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  42.26 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  36.1 
 
 		 262 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  37.72 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  35.12 
 
 		 234 aa  131  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  43.35 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  38.6 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  43.1 
 
 		 252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  37.56 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  37.65 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  39.68 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  39.39 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  38.71 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  36 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  40.86 
 
 		 248 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  41.57 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  39.27 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  44.38 
 
 		 261 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  39.11 
 
 		 256 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  41.76 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  40.43 
 
 		 251 aa  121  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  38.73 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  40 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  38.15 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  37.78 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  44.97 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  38.5 
 
 		 285 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  36.31 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  39.13 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.53 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.53 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  40.33 
 
 		 274 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  39.34 
 
 		 252 aa  118  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  42.6 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.94 
 
 		 222 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  37.02 
 
 		 253 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  38.24 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  40.2 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 240 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  43.2 
 
 		 248 aa  114  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  32.9 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  37.3 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  37.43 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  39.76 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  37.43 
 
 		 247 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  40.91 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  37.5 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  39.43 
 
 		 253 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  37.89 
 
 		 281 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  39.76 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  43.6 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  38.32 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  36.07 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  37.93 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  38.61 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  104  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  37.8 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.25 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  35.16 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  36.81 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  34.81 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  37.89 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  36.9 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  34.34 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  38.46 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.68 
 
 		 233 aa  99.4  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  42.28 
 
 		 218 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  35.42 
 
 		 261 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  34.34 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>