223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0838 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0838  putative phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0126  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.95 
 
 
276 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0113  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.78 
 
 
276 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3588  phenazine biosynthesis family protein  53.6 
 
 
277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  55.73 
 
 
277 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000932469  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.35 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1930  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.95 
 
 
301 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.7 
 
 
281 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.63 
 
 
305 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1315  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.19 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2519  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.61 
 
 
283 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2922  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.45 
 
 
306 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0549  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.77 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0551  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.8 
 
 
287 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0805  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.14 
 
 
314 aa  132  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.791564  normal  0.0825896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2885  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.73 
 
 
309 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0846454  normal  0.375181 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.2 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1456  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  34.55 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6372  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.55 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.87 
 
 
299 aa  85.9  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7039  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.96 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.660293  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.43 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  30.56 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0905  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.44 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.638343  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3076  phenazine biosynthesis protein PhzF  26.09 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6912  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.49 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2247  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.94 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.47 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3249  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  26.97 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3192  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.75 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0850826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.99 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.82 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3279  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.75 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3493  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  27.75 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3536  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.75 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.08 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1137  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.57 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.210437  normal  0.0131872 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3403  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.97 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000300678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0750  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.65 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.707799 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  30.81 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0708  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.47 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.549303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.85 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  28.12 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3114  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.16 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2025  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.47 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.98196  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0837  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  32.41 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2772  phenazine antibiotic biosynthesis related protein  28.25 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0549944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3540  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.82 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2655  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.79 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0091  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.23 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0097  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.23 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.639097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  28.1 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.08 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.2 
 
 
313 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.2 
 
 
313 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  29.85 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.75 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0253  hypothetical protein  28.46 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.42 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.49 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0582  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.46 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.51 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2671  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.87 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  27.06 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1075  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.95 
 
 
290 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2898  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.87 
 
 
309 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.270248 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.88 
 
 
299 aa  62.4  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  26.17 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.78 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.91 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55048  predicted protein  25.97 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413471  normal  0.129308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.23 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.66 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  26.44 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.95 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  31.4 
 
 
288 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0821  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.88 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.03 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1331  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.68 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.21 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1374  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.68 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.09 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.827882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.9 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0665  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.36 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449662  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.21 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.4 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3243  phenazine biosynthesis protein PhzF family  27.51 
 
 
307 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  30.58 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0381  hypothetical protein  25.74 
 
 
324 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  26.74 
 
 
300 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.42 
 
 
292 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.8 
 
 
263 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.81 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.28 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  28.97 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.03 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1819  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.78 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.88 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3435  phenazine biosynthesis protein PhzF family  24.89 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>