45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  38.03 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  33.7 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  30.45 
 
 		 253 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  30.67 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  28.82 
 
 		 244 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  27.87 
 
 		 262 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  31.52 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  32.35 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  29.82 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  32.35 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  30.99 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  31.93 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  33.73 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  33.73 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  33.13 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  31.93 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  27.03 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  27.65 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  29.52 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  27.65 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  27.65 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.53 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  25.55 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  30.16 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  26.18 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  22.73 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19650  hypothetical protein  30.91 
 
 		 250 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.09 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  31.09 
 
 		 278 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  26.42 
 
 		 270 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0498  hypothetical protein  24.39 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  31.18 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  26.32 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  24.82 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  24.82 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.79 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.14 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.72 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>