26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1154    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  60.51 
 
 
518 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  48.4 
 
 
848 aa  355  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  46.19 
 
 
746 aa  333  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  46.93 
 
 
430 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  35.18 
 
 
701 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  35.01 
 
 
410 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  34.69 
 
 
732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  35.56 
 
 
475 aa  166  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  34.73 
 
 
443 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  35.71 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  23.33 
 
 
922 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  34.04 
 
 
1033 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0321  hypothetical protein  22.92 
 
 
444 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  32.98 
 
 
1047 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  27.22 
 
 
1058 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  34.88 
 
 
270 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  34.72 
 
 
550 aa  51.2  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1658  hypothetical protein  22.29 
 
 
694 aa  50.4  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.261922  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  32.26 
 
 
1062 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  21.92 
 
 
575 aa  47  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  24.2 
 
 
727 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  34.25 
 
 
1072 aa  44.3  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  30.21 
 
 
1080 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  21.82 
 
 
731 aa  43.9  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>