15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0174 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  47.56 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  39.1 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  37.5 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  36.22 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  33.9 
 
 		 732 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  30.67 
 
 		 848 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  29.74 
 
 		 746 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  30.94 
 
 		 701 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  30.33 
 
 		 518 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  31.18 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  30 
 
 		 571 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  25 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1658  hypothetical protein  26.58 
 
 		 694 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.261922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  26.04 
 
 		 575 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>