221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2739 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2739  hypothetical protein  100 
 
 
651 aa  1330    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0522318  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3906  phosphoesterase  51.69 
 
 
415 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4462  phosphoesterase  51.69 
 
 
415 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5840  phosphoesterase  51.93 
 
 
415 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0621062  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1454  phosphoesterase  50.36 
 
 
415 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6939  phospholipase C  35.78 
 
 
496 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541284  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1268  phosphoesterase family protein  35.23 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1966  phosphoesterase family protein  35.23 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1792  phosphoesterase family protein  35.23 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1027  phosphoesterase family protein  35.23 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.041262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1756  phosphoesterase family protein  35.23 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.480824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0140  phosphoesterase family protein  35.23 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.802168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1812  phosphoesterase family protein  34.75 
 
 
495 aa  173  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1106  phosphoesterase family protein  31.21 
 
 
463 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.568201  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0968  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
486 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0331  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
486 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1863  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.360033  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0411  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1778  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
486 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100601  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0230  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1368  phosphoesterase family protein  30.73 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.468542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7067  phospholipase C  31.86 
 
 
548 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5185  Phospholipase C  30.52 
 
 
457 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3201  phosphoesterase  26.96 
 
 
434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.78084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2871  phospholipase C  27.72 
 
 
484 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971019 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08546  phosphatidylglycerol specific phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01530)  26.68 
 
 
508 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24952  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3323  phosphoesterase  26.59 
 
 
1019 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3544  phosphoesterase  25.69 
 
 
492 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559164  normal  0.930928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  28.57 
 
 
522 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4613  Phospholipase C  25.64 
 
 
474 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3537  Phospholipase C  25.64 
 
 
474 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5381  phosphoesterase  25.44 
 
 
492 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07691  phosphoesterase superfamily protein (AFU_orthologue; AFUA_1G17590)  27.43 
 
 
455 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.985467  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4899  Phospholipase C  26.85 
 
 
469 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5961  phosphoesterase  24.44 
 
 
497 aa  101  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5529  phosphoesterase  24.94 
 
 
485 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0242693 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6095  phosphoesterase  25.86 
 
 
503 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2380  acid phosphatase  25.81 
 
 
438 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  0.386209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02336  hypothetical protein similar to phospholipase C PLC-C (Eurofung)  24.49 
 
 
466 aa  90.5  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.682737  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02511  Non-hemolytic phospholipase C  25.65 
 
 
655 aa  90.1  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12373  phospholipase C 3 plcC  24.58 
 
 
516 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74886 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0521  phosphoesterase  26.5 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.64 
 
 
805 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2987  phospholipase C, phosphocholine-specific  28.34 
 
 
708 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5107  phospholipase C, phosphocholine-specific  27.19 
 
 
687 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0731  phospholipase C  26.53 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2866  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.34 
 
 
706 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.770955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3003  phospholipase C  24.34 
 
 
706 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0605  Phospholipase C  24.32 
 
 
542 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437604  normal  0.560957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2564  acid phosphatase  37.72 
 
 
456 aa  80.5  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6306  phospholipase C  22.97 
 
 
706 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2951  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.89 
 
 
705 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7081  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.58 
 
 
686 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0317  non-hemolytic phospholipase C precursor  23.73 
 
 
742 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0211  non-hemolytic phospholipase C  24.01 
 
 
717 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1519  phosphoesterase  30.41 
 
 
588 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.01497  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2512  acid phosphatase  35.54 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0200856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7094  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.28 
 
 
717 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11775  phospholipase C plcD  26.23 
 
 
514 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.54907e-25  hitchhiker  0.000000000734426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3648  acid phosphatase  30 
 
 
560 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.989112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1823  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 
561 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.825418  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0549  non-hemolytic phospholipase C precursor  23.53 
 
 
705 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0428  phosphoesterase  23.62 
 
 
704 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0372  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  23.53 
 
 
705 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5037  phospholipase C, phosphocholine-specific  23.62 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3132  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5235  phospholipase C  23.62 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.82633 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0358  non-hemolytic phospholipase C (precursor)  23.53 
 
 
705 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0005  phosphoesterase family protein  30.56 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5862  acid phosphatase  29.82 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0885625  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3923  phosphoesterase  29.82 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3875  phosphoesterase  29.82 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.824859  normal  0.170308 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4444  phosphoesterase  29.82 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653084  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7053  acid phosphatase  31.32 
 
 
567 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.847803  normal  0.202504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0886  acid phosphatase AcpA, putative  34 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0693  putative acid phosphatase AcpA  34 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1804  acid phosphatase  34 
 
 
557 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1627  acid phosphatase  34 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1648  acid phosphatase  34 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1411  putative acid phosphatase AcpA  34 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0466  putative acid phosphatase AcpA  34 
 
 
527 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00772627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4335  acid phosphatase  29.82 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1914  Phospholipase C  32.19 
 
 
538 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0169  acid phosphatase  33.59 
 
 
570 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5359  acid phosphatase  28.5 
 
 
566 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.377815  normal  0.680299 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  32.87 
 
 
715 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6264  non-hemolytic phospholipase C precursor  24.94 
 
 
709 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339495  normal  0.82782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2267  phosphoesterase family protein  32.19 
 
 
523 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2834  acid phosphatase  31.47 
 
 
538 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990662  decreased coverage  0.000779785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1301  putative acid phosphatase  31.47 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4180  acid phosphatase  28.65 
 
 
586 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293924  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1278  phosphoesterase  31.47 
 
 
533 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1142  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.77 
 
 
714 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4278  phospholipase C'  23.89 
 
 
749 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309382  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0180  phospholipase C, phosphocholine-specific  25.06 
 
 
686 aa  70.5  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  31.47 
 
 
720 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3202  acid phosphatase AcpA  27.6 
 
 
553 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2139  phospholipase C, phosphocholine-specific  24.15 
 
 
752 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0687  twin-arginine translocation pathway signal  25.23 
 
 
749 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  31.47 
 
 
720 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>