35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0649 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  822    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0097  hypothetical protein  44.5 
 
 		 413 aa  315  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4477  hypothetical protein  42.39 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0452  hypothetical protein  39.15 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.774607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0309  hypothetical protein  40.74 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76109  normal  0.259857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1675  hypothetical protein  37.93 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  0.407341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1295  hypothetical protein  35.68 
 
 		 426 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1417  hypothetical protein  32.67 
 
 		 380 aa  116  6e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3199  hypothetical protein  27.7 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.198967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0348  hypothetical protein  29.21 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2466  hypothetical protein  28.26 
 
 		 408 aa  89.7  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3487  hypothetical protein  30.86 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0832215  normal  0.193318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4326  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3716  hypothetical protein  28.99 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2357  hypothetical protein  32.93 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3693  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.489865  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0708  conserved hypothetical cytosolic protein  31.22 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0204  hypothetical protein  28.92 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1043  hypothetical protein  28.25 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.724422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5072  hypothetical protein  26.97 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.918315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4575  hypothetical protein  26.54 
 
 		 463 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0822996  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4981  hypothetical protein  25.88 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4453  hypothetical protein  24.92 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.868828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1237  hypothetical protein  25.55 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4055  hypothetical protein  28.72 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00238853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3039  hypothetical protein  31.06 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2501  hypothetical protein  23.98 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.146955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3280  hypothetical protein  26.39 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2953  hypothetical protein  28.12 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000181957 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0238  hypothetical protein  31.85 
 
 		 335 aa  53.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0563322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1796  hypothetical protein  26.32 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105142  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0483  hypothetical protein  29.41 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1184  hypothetical protein  30.48 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2029  hypothetical protein  32 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1136  hypothetical protein  25.71 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>