33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3488 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  100 
 
 		 556 aa  1144    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  58.51 
 
 		 568 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  58.15 
 
 		 565 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  42.63 
 
 		 551 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  38.18 
 
 		 555 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  37.45 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  37.59 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  37.59 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  37.43 
 
 		 552 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  36.46 
 
 		 551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  34.25 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  32.79 
 
 		 559 aa  290  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  35 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  31.82 
 
 		 530 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  35.44 
 
 		 500 aa  257  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  37.97 
 
 		 488 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  37.41 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  35.25 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  36.21 
 
 		 545 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  35.37 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  32.12 
 
 		 540 aa  217  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  36.64 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  30.95 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  27.18 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2206  hypothetical protein  33.9 
 
 		 234 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  26.37 
 
 		 490 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4972  hypothetical protein  23.16 
 
 		 549 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  23.3 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.73 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  31.66 
 
 		 315 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  25.76 
 
 		 301 aa  50.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  29.58 
 
 		 308 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  26.46 
 
 		 294 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>