More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3388 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3388  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 775 aa  1587    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1774  pyruvate, water dikinase  64.74 
 
 		 780 aa  1023    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0910  phosphoenolpyruvate synthase  41.21 
 
 		 831 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1972  PEP-utilising protein mobile region  43.85 
 
 		 770 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3993  PEP-utilising protein mobile region  42.4 
 
 		 761 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.800573  normal  0.608484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3944  Pyruvate, water dikinase  42.53 
 
 		 761 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2277  Pyruvate, water dikinase  41.41 
 
 		 773 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.48 
 
 		 758 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 758 aa  399  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  31.73 
 
 		 758 aa  399  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.36 
 
 		 810 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  31.56 
 
 		 765 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 		 809 aa  349  1e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.61 
 
 		 782 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  29.11 
 
 		 764 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  29.4 
 
 		 809 aa  333  6e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  30.17 
 
 		 754 aa  332  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  30.24 
 
 		 810 aa  330  9e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.4 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  30.17 
 
 		 812 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  29.45 
 
 		 824 aa  327  7e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  29.52 
 
 		 779 aa  325  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.59 
 
 		 758 aa  324  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  28.47 
 
 		 758 aa  324  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 		 757 aa  323  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  30.15 
 
 		 760 aa  320  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.9 
 
 		 781 aa  320  7e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  28.7 
 
 		 794 aa  318  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  29.39 
 
 		 769 aa  317  6e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  28.78 
 
 		 788 aa  312  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  29.75 
 
 		 780 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  29.79 
 
 		 799 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  29.16 
 
 		 785 aa  300  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  29.23 
 
 		 761 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  28.38 
 
 		 762 aa  296  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  27.53 
 
 		 762 aa  295  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  27.06 
 
 		 758 aa  294  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.01 
 
 		 785 aa  292  2e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  28.75 
 
 		 761 aa  290  7e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  27.8 
 
 		 760 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  27.56 
 
 		 789 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 		 805 aa  270  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  27.9 
 
 		 796 aa  263  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  26.98 
 
 		 791 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  27.44 
 
 		 798 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 		 791 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  28.35 
 
 		 804 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 		 815 aa  254  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  27.59 
 
 		 812 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  27.31 
 
 		 793 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  28.37 
 
 		 804 aa  252  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  27.24 
 
 		 792 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  27.54 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  26.66 
 
 		 795 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  26.86 
 
 		 795 aa  250  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  28.72 
 
 		 819 aa  250  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  27.83 
 
 		 825 aa  250  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 		 793 aa  248  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  26.12 
 
 		 792 aa  246  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  26.68 
 
 		 799 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  26.97 
 
 		 786 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  26.96 
 
 		 792 aa  245  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  26.63 
 
 		 809 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  27.74 
 
 		 798 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  27.74 
 
 		 798 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  27.74 
 
 		 798 aa  244  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  26.98 
 
 		 814 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  26.01 
 
 		 790 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  27.01 
 
 		 791 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  27.83 
 
 		 791 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  28.38 
 
 		 801 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  27.35 
 
 		 790 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  27.46 
 
 		 792 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  27.58 
 
 		 791 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  27.58 
 
 		 791 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 		 791 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  26.41 
 
 		 790 aa  240  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  28.02 
 
 		 801 aa  240  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 		 800 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  27.1 
 
 		 791 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 		 800 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  28.28 
 
 		 796 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 		 800 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  27.25 
 
 		 797 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 		 790 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  25.4 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 		 799 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  27.74 
 
 		 790 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  25.4 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 		 799 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 		 792 aa  239  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  27.7 
 
 		 795 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  27.44 
 
 		 832 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  26.8 
 
 		 803 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>