46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3049 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  72.14 
 
 
140 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  41.91 
 
 
157 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  36.51 
 
 
127 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  28.89 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0445  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1728  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2373  hypothetical protein  28.32 
 
 
556 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000294292  hitchhiker  0.0000289236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2627  protein of unknown function DUF442  28.43 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360965  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1495  hypothetical protein  29.01 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  25.56 
 
 
165 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0889  hypothetical protein  28.32 
 
 
554 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0947  hypothetical protein  31.03 
 
 
554 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  30.36 
 
 
244 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  28.3 
 
 
241 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  23.14 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2887  protein of unknown function DUF442  27.45 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2123  hypothetical protein  26.47 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.233135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  31.37 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1568  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.83 
 
 
439 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1671  hypothetical protein  26.57 
 
 
216 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4658  hypothetical protein  24.11 
 
 
432 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  26.56 
 
 
431 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1414  protein of unknown function DUF442  23.78 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1200  protein of unknown function DUF442  25.17 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.311245  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0882  hypothetical protein  32.26 
 
 
365 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  29.51 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1253  hypothetical protein  23.78 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255704  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2867  hypothetical protein  27.84 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444825  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1915  hypothetical protein  29.93 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0814  hypothetical protein  31.68 
 
 
127 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.889382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  25.53 
 
 
204 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4436  protein of unknown function DUF442  25 
 
 
157 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1025  protein of unknown function DUF442  31.07 
 
 
114 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.469221  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00088  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  27.01 
 
 
557 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0674  hypothetical protein  29.36 
 
 
551 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1813  hypothetical protein  26.98 
 
 
554 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2233  hypothetical protein  26.53 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000334371  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3820  hypothetical protein  22.12 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1784  hypothetical protein  31.82 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000771749 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0697  hypothetical protein  28.18 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.289026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0652  hypothetical protein  28.97 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  27.69 
 
 
363 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2938  hypothetical protein  25 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2070  hypothetical protein  23.47 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  21.58 
 
 
202 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>