55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2613 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2613  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
187 aa  352  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  58.92 
 
 
180 aa  201  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  49.73 
 
 
179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  50.9 
 
 
178 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  50.3 
 
 
178 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1490  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.97 
 
 
181 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0893456  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  49.73 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  45.28 
 
 
171 aa  121  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04811  F0F1 ATP synthase subunit B  36.2 
 
 
172 aa  94.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15721  F0F1 ATP synthase subunit B  34.76 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1546  F0F1 ATP synthase subunit B  32.91 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  32.72 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  32.72 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
170 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16321  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.339041  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0486  F0F1 ATP synthase subunit B  38.89 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.405146  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2190  F0F1 ATP synthase subunit B  43.9 
 
 
160 aa  62  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.67 
 
 
178 aa  61.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.03 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25.15 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  26.47 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  31.28 
 
 
181 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  27.94 
 
 
179 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
167 aa  51.2  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.36 
 
 
164 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  28.77 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.99 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  27.44 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.09 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  25.61 
 
 
175 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.79 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3410  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.32 
 
 
206 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00419631  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.11 
 
 
181 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  24.69 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  26.01 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  26.22 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.18 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  24.86 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  25.61 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  24.22 
 
 
245 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  29.34 
 
 
182 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.14 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.88 
 
 
189 aa  41.2  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  24.2 
 
 
165 aa  41.2  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  23.42 
 
 
164 aa  41.2  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>