51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1293 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1316    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  62.13 
 
 
642 aa  787    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  46.61 
 
 
644 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  45.96 
 
 
603 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  44.88 
 
 
625 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  44.72 
 
 
625 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  37.22 
 
 
605 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0325  hypothetical protein  40 
 
 
561 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23591  hypothetical protein  34.95 
 
 
583 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2017  hypothetical protein  35.22 
 
 
589 aa  190  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.97 
 
 
921 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  24.45 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  24.28 
 
 
718 aa  84  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1164  hypothetical protein  27.66 
 
 
312 aa  83.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  26.91 
 
 
686 aa  82.8  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 
514 aa  80.1  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0854  hypothetical protein  26.79 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  25.15 
 
 
833 aa  77.8  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  24.4 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  25 
 
 
952 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
1118 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  23.55 
 
 
553 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  27.21 
 
 
756 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  25 
 
 
1426 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
486 aa  63.9  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  22.38 
 
 
553 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0026  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.77 
 
 
316 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  24.14 
 
 
1327 aa  60.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.17 
 
 
420 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1487  hypothetical protein  23.68 
 
 
528 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  37.89 
 
 
289 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1696  hypothetical protein  26.64 
 
 
497 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000842618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  21.3 
 
 
534 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  21.78 
 
 
652 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  30.83 
 
 
929 aa  55.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  33.02 
 
 
249 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2719  hypothetical protein  22.79 
 
 
476 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  22.92 
 
 
1138 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  24.48 
 
 
913 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  33.62 
 
 
444 aa  50.8  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
331 aa  48.9  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  29.9 
 
 
203 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  38.24 
 
 
304 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  25 
 
 
465 aa  45.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  32.35 
 
 
259 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  38.1 
 
 
296 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
382 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  33.01 
 
 
255 aa  44.3  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  33.01 
 
 
255 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  33.98 
 
 
296 aa  43.9  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>