24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0272 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  100 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  51.41 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  39.86 
 
 		 147 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  36.55 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  39.31 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  38.36 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  30.08 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  39.85 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  32.62 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  32.77 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  28.36 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  40.68 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  26.45 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0239  PilT domain-containing protein  26.72 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0441  PilT domain-containing protein  29.31 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00845151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  23.97 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  24.82 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  25.42 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>