148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2898 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
466 aa  912    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  70.85 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  49.16 
 
 
460 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  46.27 
 
 
453 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  45.69 
 
 
447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  43.74 
 
 
485 aa  345  8.999999999999999e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  45.99 
 
 
410 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  47.51 
 
 
457 aa  332  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  31.94 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  29.79 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 
461 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 
461 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 
435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 
433 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  32.24 
 
 
437 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
437 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  32.84 
 
 
419 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  28.29 
 
 
416 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  28.79 
 
 
440 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  28.63 
 
 
432 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  31.39 
 
 
427 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  31.06 
 
 
422 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  26.17 
 
 
440 aa  156  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 
436 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  27.67 
 
 
441 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
440 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  26.17 
 
 
440 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  27 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  26.69 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  26.69 
 
 
450 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  27.46 
 
 
440 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  26.69 
 
 
450 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  27.77 
 
 
451 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  26.69 
 
 
450 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  26.69 
 
 
450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  27.77 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  27.53 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  28.88 
 
 
447 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  26.36 
 
 
468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  27.97 
 
 
442 aa  146  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  29.69 
 
 
440 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  29.69 
 
 
440 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.11 
 
 
440 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 
440 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  27.56 
 
 
451 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  27.56 
 
 
451 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  26.79 
 
 
450 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  28.51 
 
 
455 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.48 
 
 
440 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  27.35 
 
 
451 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.69 
 
 
442 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  27.31 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  29.48 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  26.68 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  28 
 
 
446 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  27.1 
 
 
441 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.14 
 
 
442 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  28.64 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  27.72 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  26.22 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.37 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  29.04 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25.94 
 
 
438 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.24 
 
 
435 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.33 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  26.08 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  25.54 
 
 
432 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  29.93 
 
 
439 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.88 
 
 
441 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  27.56 
 
 
439 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  34.72 
 
 
449 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  28.57 
 
 
430 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  26.67 
 
 
430 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 
435 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 
474 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  24.17 
 
 
439 aa  96.7  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  28.57 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  27.83 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  26.4 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  26.48 
 
 
441 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  25.42 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  23.58 
 
 
460 aa  91.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  22.93 
 
 
452 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
468 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  24.66 
 
 
463 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>