More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1777 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  70.54 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  65.12 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  59.69 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  55.81 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  55.04 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3212  MerR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356219  normal  0.122177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3662  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  42.97 
 
 		 146 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.25 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0693  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  41.96 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.5 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  41.51 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  40.3 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  38.21 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  36.64 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  87.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  40.78 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  40.17 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  35.56 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1955  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 128 aa  84.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 143 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.52 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  39.09 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  44 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  41.03 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  38.02 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>