More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0792 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  45.77 
 
 
205 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  46.7 
 
 
199 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  46.15 
 
 
199 aa  204  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  47.74 
 
 
200 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  47.45 
 
 
198 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  44.67 
 
 
197 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  44.67 
 
 
197 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  46.15 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  44.22 
 
 
199 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1719  recombination protein RecR  48.97 
 
 
194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  44.62 
 
 
199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  43.88 
 
 
198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  43.65 
 
 
199 aa  197  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  45.41 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  46.43 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  46.56 
 
 
189 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  43.59 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  46.19 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  43.22 
 
 
199 aa  195  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  45 
 
 
202 aa  196  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  45.08 
 
 
198 aa  195  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  43.59 
 
 
199 aa  195  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  44.1 
 
 
199 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09731  recombination protein RecR  44.44 
 
 
189 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  43.65 
 
 
199 aa  194  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  41.62 
 
 
199 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  44.9 
 
 
198 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  44 
 
 
199 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  42.13 
 
 
199 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  43.08 
 
 
199 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  44.39 
 
 
198 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  44.22 
 
 
199 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  43.72 
 
 
199 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  46.67 
 
 
204 aa  191  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  47.03 
 
 
185 aa  191  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0894  recombination protein RecR  43.39 
 
 
205 aa  191  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  41.04 
 
 
215 aa  190  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  43.88 
 
 
198 aa  190  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  43.88 
 
 
198 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  41.62 
 
 
199 aa  190  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  43.88 
 
 
198 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  42.71 
 
 
199 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  43.15 
 
 
199 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  42.21 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  43.88 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  41.21 
 
 
199 aa  188  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  42.71 
 
 
199 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0103  recombination protein RecR  44.78 
 
 
205 aa  188  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  43.88 
 
 
198 aa  188  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  42.71 
 
 
199 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  44.16 
 
 
198 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  43.08 
 
 
204 aa  187  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  40.1 
 
 
199 aa  187  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  40.91 
 
 
202 aa  187  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  43.22 
 
 
211 aa  187  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  45.88 
 
 
195 aa  187  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1399  recombination protein RecR  43.75 
 
 
192 aa  187  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.612922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  42.86 
 
 
198 aa  187  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  42.71 
 
 
199 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  42.27 
 
 
198 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  42.27 
 
 
198 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  41.45 
 
 
198 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  45.6 
 
 
182 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  42.27 
 
 
198 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  44.22 
 
 
200 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  41.12 
 
 
199 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  42.13 
 
 
199 aa  185  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  43.3 
 
 
201 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  43 
 
 
200 aa  185  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  44.39 
 
 
222 aa  185  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  45.27 
 
 
205 aa  185  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  40.2 
 
 
199 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  44.56 
 
 
200 aa  184  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  43.15 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  41.71 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  44.1 
 
 
204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  41.12 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  42.13 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  44.22 
 
 
199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  43.14 
 
 
204 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  46.15 
 
 
204 aa  182  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  41.33 
 
 
219 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  43.22 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  46.15 
 
 
182 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  41.24 
 
 
200 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  46.15 
 
 
182 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  43.68 
 
 
195 aa  179  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  42.13 
 
 
203 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  41.45 
 
 
203 aa  179  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  40.61 
 
 
197 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  40.1 
 
 
199 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>