More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0747 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 296 aa  605  9.999999999999999e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00157591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.3 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  27.03 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  27.03 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  27.03 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  26.69 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  27.03 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  26.69 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  26.69 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  24.49 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  27.3 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3317  Cof-like hydrolase  25.53 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000026375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  26.64 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.66 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  26.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  26.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  26.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  26.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  26.42 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  26.26 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  26.26 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  25.61 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  49.3 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  24.56 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  24 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  24.56 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  24.56 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  24.56 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  24.21 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  23.76 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  24.21 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  24.56 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  24.83 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  24.83 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  24.83 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  26.07 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  24.58 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.36 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  22.55 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  27.7 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  25.17 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  23.55 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  23.55 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  24.65 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.42 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.42 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  23.55 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  24.31 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  22.07 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  27.05 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  24.28 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  26.5 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  24.4 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  26.06 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  26.06 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  27.09 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.21 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0258  Cof-like hydrolase  25.35 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000345946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  23.63 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1225  HAD superfamily hydrolase  22.34 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  23.27 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  24.83 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  23.27 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.27 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  23.27 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0949  Cof-like hydrolase  24.09 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000135628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  25.54 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.46 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  22.55 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  24.36 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  25.27 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  23.97 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  22.36 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  25.86 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.09 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  26.43 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  25.18 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  25.18 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  26.09 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  22.81 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  23.16 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  32.58 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.24 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  24.24 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  24.24 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  24.1 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>