29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0588 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  100 
 
 		 959 aa  1897    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  23.69 
 
 		 874 aa  200  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  34.06 
 
 		 737 aa  151  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  22.92 
 
 		 1137 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  21.01 
 
 		 1084 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  23.41 
 
 		 1155 aa  68.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  23.41 
 
 		 1155 aa  68.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  26.52 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  25.4 
 
 		 989 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  25.4 
 
 		 989 aa  63.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  24.07 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  24.07 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  23.82 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  34.78 
 
 		 733 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1886  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.66 
 
 		 1211 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0934  Phage tail tape measure protein TP901, core region  30.66 
 
 		 1211 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  21.97 
 
 		 716 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3818  TP901 family phage tail tape measure protein  29.93 
 
 		 1211 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  28 
 
 		 877 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3658  phage tail tape measure protein, TP901 family  28.89 
 
 		 733 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  21.65 
 
 		 786 aa  49.7  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  25.26 
 
 		 950 aa  49.3  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  23.56 
 
 		 1136 aa  48.5  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  23.56 
 
 		 1136 aa  48.5  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  25.56 
 
 		 1077 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  36 
 
 		 907 aa  48.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  33.33 
 
 		 759 aa  45.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  21.97 
 
 		 871 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  36.11 
 
 		 814 aa  44.3  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>