More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0400 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  100 
 
 		 379 aa  772    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  36.89 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  31.63 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  43.01 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  29.35 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  29.74 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  25 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  29.95 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  25.17 
 
 		 375 aa  90.5  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  24.52 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  27.14 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  29.24 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  29.24 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  26.46 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  24.56 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  29.59 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  28.49 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  22.3 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  22.96 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  21.85 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  27.05 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  28.8 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  26.32 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  26.44 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  25.45 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  26.01 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  25.45 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.34 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  25 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  27.45 
 
 		 447 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.25 
 
 		 453 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  22.76 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.13 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1459  FeS assembly protein SufD  24.39 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  23.65 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1413  FeS assembly protein SufD  23.98 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  25 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  26.34 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  26.34 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  29.2 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.34 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.34 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.34 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.34 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  25.98 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.34 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  26.01 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  26.34 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  23.47 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  24.05 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  23.67 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  23.33 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  21.35 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  24.1 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  24.36 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  25.32 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  24.62 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  23.48 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  28.07 
 
 		 430 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  23.04 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  28.78 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  18.7 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  23.51 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  24.44 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.16 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  26.17 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  23.53 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.56 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  23.53 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  23.17 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  26.04 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  21.79 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  24.84 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  25.66 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  24.53 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  23.13 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.9 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  21.14 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  26.34 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  25.19 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  21.11 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  20.74 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  22.81 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.09 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  23.16 
 
 		 475 aa  57  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.11 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  27.31 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  26.53 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.79 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10147  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  23.85 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0858982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.79 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>