30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1737 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1737  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 248 aa  457  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1813  putative transmembrane anti-sigma factor  95.97 
 
 		 248 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2144  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  92.34 
 
 		 247 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2379  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.58 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1488  putative transmembrane anti-sigma factor  31.41 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0977  putative transmembrane anti-sigma factor  29.46 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.88 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3435  putative transmembrane anti-sigma factor  24.2 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4687  putative anti-sigma factor  25.78 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139907  normal  0.0591052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1485  putative transmembrane anti-sigma factor  30.88 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  26.24 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1580  putative transmembrane anti-sigma factor  30.88 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  32.35 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  29.35 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  23.71 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  31.58 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  29.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  28.93 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  30.65 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  30.1 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0596  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  27.14 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0787  putative transmembrane anti-sigma factor  26.58 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  33.7 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  29.91 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  34.67 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  42.11 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1898  putative transmembrane anti-sigma factor  29.82 
 
 		 297 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307519  hitchhiker  0.000000565646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1875  putative transmembrane anti-sigma factor  29.82 
 
 		 299 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  33.15 
 
 		 261 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6204  putative transmembrane anti-sigma factor  29.82 
 
 		 299 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>