30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2057 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  339  8e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  34.96 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  31.19 
 
 
321 aa  58.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  28.36 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  27.12 
 
 
155 aa  57.4  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  29.92 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  30.3 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  28.1 
 
 
274 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  24.09 
 
 
350 aa  51.6  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  30.77 
 
 
339 aa  51.6  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  29.75 
 
 
750 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  32.99 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  28.35 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  26.05 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  26.04 
 
 
176 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  29.17 
 
 
421 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0111  hypothetical protein  26.27 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0651  hypothetical protein  26.28 
 
 
188 aa  47.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  30.19 
 
 
144 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  30.11 
 
 
357 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  24.68 
 
 
172 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  24.17 
 
 
326 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4409  hypothetical protein  24.07 
 
 
217 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  27.35 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  25.83 
 
 
314 aa  41.6  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0852  hypothetical protein  30.83 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.25 
 
 
421 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 
789 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2045  hypothetical protein  28.44 
 
 
171 aa  40.8  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0106113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>