167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0858 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 		 347 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  39.15 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.04 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  33.46 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.31 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.31 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  31.99 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  32.15 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.4 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  31.4 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  31.53 
 
 		 322 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  29.96 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.1 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  28.37 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  28.37 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.37 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  27.64 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.9 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.48 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  28.57 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  26.42 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  26.44 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28880  hypothetical protein  25.58 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  27.75 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.47 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  27.85 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.44 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.36 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  26.32 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.49 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  29.91 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  26.32 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  26.32 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  26.32 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  27.65 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.52 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.1 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.45 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.74 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.54 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  26.32 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.63 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.89 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.31 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.18 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  27.05 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.36 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.27 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.11 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.36 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  27.87 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  26.34 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.96 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.5 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.5 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  26.73 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  26.17 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.66 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.19 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.76 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.17 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.17 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  25.1 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.29 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.6 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3817  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.51 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.94 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.27 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.23 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  25.23 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.61 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  25.23 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.17 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  25.69 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  26.64 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  25.35 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  27.69 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.79 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.24 
 
 		 282 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.89 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  25.12 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  25.94 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05290  predicted metalloprotease  24.88 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  24.76 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.41 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4716  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  23.74 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>