27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4167 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4167  TraG domain-containing protein  100 
 
 		 1015 aa  2085    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.554072 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6815  TraG domain-containing protein  44.55 
 
 		 1313 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2331  hypothetical protein  30.08 
 
 		 923 aa  201  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2664  hypothetical protein  29.49 
 
 		 924 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1524  TraG domain-containing protein  31.51 
 
 		 923 aa  195  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630102  normal  0.653748 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0029  hypothetical protein  23.86 
 
 		 935 aa  172  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0014  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.13 
 
 		 940 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_18  conjugative transfer protein TraG  25.72 
 
 		 931 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4304  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  23 
 
 		 1051 aa  134  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2169  TraG-like  25.65 
 
 		 900 aa  132  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0003  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraG  24.09 
 
 		 960 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4618  TraG domain-containing protein  23.58 
 
 		 939 aa  127  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4513  TraG domain protein  25.24 
 
 		 942 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4432  TraG domain-containing protein  25.29 
 
 		 936 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4388  TraG domain protein  25.29 
 
 		 937 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.812374 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4526  TraG domain-containing protein  25.29 
 
 		 937 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.769424 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4427  TraG domain protein  25.29 
 
 		 937 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0037  hypothetical protein  22.2 
 
 		 919 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5383  TraG domain-containing protein  23.57 
 
 		 938 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00832018  normal  0.693135 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1136 aa  105  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0941  Cju26  23.16 
 
 		 922 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247949  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0805  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1093 aa  55.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1594  sex pilus assembly  23.27 
 
 		 1145 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0376  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1172 aa  50.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1107  TraG-like protein  28.49 
 
 		 529 aa  49.3  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0305  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1205 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0189  type IV conjugative transfer system protein TraG  22.1 
 
 		 1204 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>