26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2421 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  97.01 
 
 		 201 aa  363  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  38.58 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  38.78 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  38.27 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  37.37 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  36.7 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  38.38 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  38.78 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  35.33 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  35.53 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  36.73 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  34.68 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  34.01 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  30.43 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  36.26 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  32.97 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  30.96 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  28.73 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  31.52 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  27.98 
 
 		 177 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  34.43 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  26.26 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  28.18 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  29.35 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>