78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0256 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 168 aa  339  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  98.81 
 
 		 168 aa  335  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  71.43 
 
 		 171 aa  233  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  59.52 
 
 		 168 aa  208  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  59.64 
 
 		 166 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  41.1 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.41 
 
 		 138 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.84 
 
 		 138 aa  97.1  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  41.79 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  35.61 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.46 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  37.16 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  36.42 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  36.97 
 
 		 152 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  39.5 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  42.02 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.7 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  34.38 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  38.17 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  38.64 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  32.59 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  34.71 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  33.06 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  34.15 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  35.34 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  35.25 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  30.33 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  25.37 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1179  hemerythrin-like metal-binding protein  36.21 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.33845  hitchhiker  0.0043388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  32.14 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  32.14 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  29.17 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.95 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  23.48 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  23.81 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  21.8 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  28.93 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.22 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  31.97 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 736 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.38 
 
 		 963 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  31.29 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.87 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 667 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  23.85 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  21.8 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.45 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  22.58 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2455  hemerythrin-like metal-binding protein  28.76 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  27.48 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.01 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  21.54 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  25.52 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  27.66 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  28 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  25.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  27.48 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  23.44 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  25.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  27.74 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  22.96 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  23.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  26.36 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  24.41 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.79 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  24.81 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>