189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1993 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 479 aa  939    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  40.08 
 
 		 612 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  29.25 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  35.27 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  28.12 
 
 		 518 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  28.41 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  28.94 
 
 		 498 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  28.27 
 
 		 520 aa  166  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  33.85 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  33.44 
 
 		 640 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  29.25 
 
 		 462 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  31.37 
 
 		 420 aa  163  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.39 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  31.37 
 
 		 424 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  31.6 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  34.63 
 
 		 626 aa  161  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  30.93 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  29.55 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  34.06 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  31.15 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  33.79 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  30.3 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  34.59 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  31.31 
 
 		 521 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  30.43 
 
 		 515 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  33.55 
 
 		 492 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  30.86 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  29.04 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  33.88 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  30.49 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  29.4 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  29.4 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  31.35 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  31.35 
 
 		 519 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  30.72 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  32.42 
 
 		 548 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  36.54 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  28.06 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  29.28 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  34.89 
 
 		 453 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  32.03 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  29.62 
 
 		 427 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  33.98 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  32.31 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  29.51 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  35.77 
 
 		 491 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  35.2 
 
 		 491 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  30.93 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  30.52 
 
 		 506 aa  146  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  30.58 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  32.86 
 
 		 504 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  28.25 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  31.25 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  30.19 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  33.46 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  33.44 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  30.91 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  30.9 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  32.23 
 
 		 545 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  30.15 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  33.58 
 
 		 467 aa  140  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  30.56 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  35.64 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  29.82 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  25.07 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  28.98 
 
 		 532 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  29.39 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  32.57 
 
 		 531 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  29.34 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  32.38 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  33.54 
 
 		 386 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  25.07 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  31.92 
 
 		 630 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  30 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  28.57 
 
 		 513 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  30 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  30 
 
 		 475 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  30 
 
 		 475 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  27.52 
 
 		 494 aa  136  7.000000000000001e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  30 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  31.35 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  30 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  30 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  30 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  31.83 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  28.88 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  31.21 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  28.88 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  32.08 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  28.88 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.88 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  30.18 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  36.76 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  27.87 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  36.07 
 
 		 398 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  27.58 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  27.87 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  27.87 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  27.87 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>