More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1765 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1765  adenosylhomocysteinase  100 
 
 
425 aa  855    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0766  adenosylhomocysteinase  66.19 
 
 
421 aa  564  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.206287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4055  adenosylhomocysteinase  66.27 
 
 
420 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0524  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
421 aa  554  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0211  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.82 
 
 
418 aa  548  1e-155  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.06 
 
 
418 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3564  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.06 
 
 
420 aa  542  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0488  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.52 
 
 
431 aa  531  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.23 
 
 
418 aa  531  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_454  S-adenosylhomocysteine hydrolase  61.47 
 
 
418 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3662  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.19 
 
 
426 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.253183  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.99 
 
 
418 aa  528  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.185841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0159  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.81 
 
 
420 aa  527  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0618  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.21 
 
 
426 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892985  normal  0.578524 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0793  adenosylhomocysteinase  61.43 
 
 
413 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2352  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.63 
 
 
420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0847  adenosylhomocysteinase  60.24 
 
 
425 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4402  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.85 
 
 
428 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000312521  normal  0.874469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0764  adenosylhomocysteinase  62.14 
 
 
420 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.114058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3754  adenosylhomocysteinase  61.81 
 
 
420 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4609  adenosylhomocysteinase  59.57 
 
 
422 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1393  Adenosylhomocysteinase  63.25 
 
 
413 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4381  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.38 
 
 
429 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2416  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.48 
 
 
425 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3963  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.65 
 
 
425 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128582  hitchhiker  0.00348944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2366  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.24 
 
 
425 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1811  adenosylhomocysteinase  57.88 
 
 
436 aa  498  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2623  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.14 
 
 
425 aa  500  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114233  normal  0.339873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1209  adenosylhomocysteinase  57.78 
 
 
419 aa  496  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.971819  normal  0.0566863 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2686  adenosylhomocysteinase  57.65 
 
 
425 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1004  adenosylhomocysteinase  57.14 
 
 
418 aa  475  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1666  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.33 
 
 
439 aa  471  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1128  adenosylhomocysteinase  56.12 
 
 
426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0357  adenosylhomocysteinase  52.61 
 
 
422 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1787  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.61 
 
 
436 aa  462  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000671354 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.3 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1599  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.16 
 
 
436 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.171763  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  56.25 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0883  adenosylhomocysteinase  53.11 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000768348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  54.94 
 
 
419 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0727  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.62 
 
 
437 aa  455  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.42 
 
 
437 aa  457  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0167  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.33 
 
 
415 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.636373 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0213  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.62 
 
 
415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0145885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0706  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.05 
 
 
417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.1 
 
 
421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0965  adenosylhomocysteinase  55.95 
 
 
416 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1187  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.5 
 
 
417 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00223621  normal  0.0169924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0516  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.2 
 
 
442 aa  451  1e-125  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0503497  normal  0.0605456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3048  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.9 
 
 
428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000864527  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1735  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.67 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4355  adenosylhomocysteinase  55.32 
 
 
419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506408  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3251  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.22 
 
 
411 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1181  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.05 
 
 
411 aa  441  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0617  adenosylhomocysteinase  53.88 
 
 
432 aa  442  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2063  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.96 
 
 
418 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000172774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17500  adenosylhomocysteinase  52.87 
 
 
414 aa  428  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.778784  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2168  adenosylhomocysteinase  50.96 
 
 
415 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1200  adenosylhomocysteinase  51.08 
 
 
414 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.51661  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0646  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.77 
 
 
408 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0468936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0360  adenosylhomocysteinase  53.35 
 
 
417 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0567  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.05 
 
 
410 aa  423  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.200661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0649  adenosylhomocysteinase  53.21 
 
 
417 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1547  adenosylhomocysteinase  50.49 
 
 
403 aa  415  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0905  adenosylhomocysteinase  47.84 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1411  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.12 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0147  adenosylhomocysteinase  51.33 
 
 
429 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0660  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.39 
 
 
408 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0756  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.04 
 
 
425 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0956  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.84 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.309777  normal  0.704835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1035  adenosylhomocysteinase  51.79 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.980475  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1513  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.06 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0753  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.88 
 
 
404 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0776  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.14 
 
 
404 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1849  adenosylhomocysteinase  51.33 
 
 
427 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0059  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.16 
 
 
429 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00179042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1484  adenosylhomocysteinase  47.23 
 
 
415 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1765  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  47.17 
 
 
399 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0136  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.96 
 
 
401 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0964  adenosylhomocysteinase  50.12 
 
 
413 aa  384  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00139525 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1467  adenosylhomocysteinase  45.26 
 
 
408 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0050  adenosylhomocysteinase  49.51 
 
 
421 aa  358  7e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.54 
 
 
416 aa  352  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.205607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.95 
 
 
437 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  42.79 
 
 
417 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  45.48 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.6 
 
 
492 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  41.81 
 
 
492 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.33 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.1 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  46.1 
 
 
441 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.1 
 
 
438 aa  333  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.1 
 
 
434 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.83 
 
 
476 aa  332  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.4 
 
 
476 aa  332  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  41.54 
 
 
476 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  43.33 
 
 
435 aa  329  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  40.17 
 
 
519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  44.21 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  42.46 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>