More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0913 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  100 
 
 
176 aa  338  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  39.74 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  38.55 
 
 
209 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  38.24 
 
 
173 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  37.04 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  37.04 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  38.82 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  37.35 
 
 
174 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  41.72 
 
 
171 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.13 
 
 
220 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  40.48 
 
 
170 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  33.91 
 
 
187 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.72 
 
 
185 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.16 
 
 
197 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  37.04 
 
 
173 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  34.71 
 
 
176 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  39.18 
 
 
185 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0778  signal peptidase I  40.64 
 
 
191 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  33.15 
 
 
220 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  33.7 
 
 
191 aa  100  9e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  33.73 
 
 
214 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  33.96 
 
 
186 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  35.26 
 
 
217 aa  99.8  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  35.67 
 
 
199 aa  99  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  33.33 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  34.1 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  32.16 
 
 
190 aa  98.6  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.73 
 
 
190 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  35.8 
 
 
215 aa  97.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.73 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  32.11 
 
 
215 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  29.82 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  39.38 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  31.35 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  30.36 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  31.35 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  36.81 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  36.3 
 
 
189 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  31.98 
 
 
263 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  32.42 
 
 
183 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  31.98 
 
 
263 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  29.35 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  33.33 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  35.62 
 
 
203 aa  92.8  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  36.87 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  28.95 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  32.11 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  31.32 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2863  signal peptidase I  29.28 
 
 
173 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.752268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  92  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  33.95 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  30.77 
 
 
183 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  32.2 
 
 
201 aa  90.9  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  28.42 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  34.88 
 
 
200 aa  90.9  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2801  signal peptidase I  30.94 
 
 
173 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.241718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  34.57 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  30.37 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  32.2 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  32.2 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  30.93 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  28.42 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  30.22 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  32.2 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  31.58 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  43.04 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  31.98 
 
 
226 aa  90.1  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  30.37 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  30.77 
 
 
268 aa  89.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3112  Signal peptidase I  30.94 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2871  Signal peptidase I  30.94 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0582592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2841  signal peptidase I  30.94 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000384139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3086  Signal peptidase I  30.94 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3092  signal peptidase I  30.94 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1333  Signal peptidase I  30.9 
 
 
205 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3111  signal peptidase I  30.39 
 
 
173 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.349413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  42.25 
 
 
207 aa  89  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  28.96 
 
 
177 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  35.23 
 
 
220 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  33.7 
 
 
263 aa  89  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  35.29 
 
 
267 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  32.2 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  31.86 
 
 
299 aa  88.6  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  29.73 
 
 
297 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  27.89 
 
 
183 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  31.4 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  29.73 
 
 
297 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  29.73 
 
 
297 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>