167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0127 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0127  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  44.68 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  44.44 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  41.73 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2643  bacterioferritin  38.19 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3194  ferritin Dps family protein  37.84 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  31.13 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  31.3 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  33.59 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  32.82 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  32.06 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  31.3 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  31.3 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  29.55 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  28.26 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  31.3 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  28.67 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  29.77 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  29.71 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  29.71 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  29.77 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  29.01 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0847  rubrerythrin  31.11 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  27.54 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  27.48 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  29.77 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  29.01 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  29.71 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  26.47 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  25.87 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  25 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  27.15 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.53 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  24.26 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  25.17 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  28.67 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  26.15 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  26.72 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  25.95 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  27.81 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  24.26 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  24.64 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  24.48 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  26.77 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  22.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  27.66 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  27.64 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  27.48 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  25.19 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  27.48 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  25.95 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  25.58 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  25 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  22.97 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  27.48 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  28.7 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  28.7 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  28.7 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  28.57 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  28.7 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  28.7 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  24.41 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  25.95 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  26.47 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  26.24 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  24.41 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  25.2 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  25.93 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  25.95 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  25 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  25 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  25 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  23.53 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  24.26 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  27.66 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  22.9 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  23.53 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  22.14 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  24.43 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  24.43 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  21.99 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  22.06 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  22.06 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4073  bacterioferritin  27.59 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.927723  normal  0.896051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  24.43 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  25.21 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  23.66 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  22.46 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  24.43 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  24.37 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  22.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  22.46 
 
 		 224 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  22.14 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  22.46 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  22.46 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  23.66 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  22.46 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  22.46 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  23.66 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  23.66 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>