128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3678 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  97.27 
 
 
111 aa  224  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  97.27 
 
 
111 aa  224  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  67.27 
 
 
109 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2433  protein of unknown function DUF971  45.16 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0839249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  41.77 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  37.5 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2270  hypothetical protein  36.46 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.647055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  37.37 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  35.56 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  44.26 
 
 
438 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  33.7 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2736  hypothetical protein  35.37 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0430  hypothetical protein  32.29 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0623601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  34.41 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  46.15 
 
 
398 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2074  hypothetical protein  31.18 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1325  protein of unknown function DUF971  35.8 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  34.02 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  30.95 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  30.43 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1386  hypothetical protein  31.33 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  30.85 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0527  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0058  protein of unknown function DUF971  30.11 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.563148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4118  hypothetical protein  29.79 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3766  hypothetical protein  32.93 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000239528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  38.04 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3645  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.785691  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4164  hypothetical protein  30.53 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  33.77 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0552  hypothetical protein  31.65 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  29.79 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  36.25 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0370  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.040295  normal  0.643412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  36.25 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0429  hypothetical protein  31.18 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  29.79 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2342  hypothetical protein  43.33 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3523  hypothetical protein  29.47 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0432  hypothetical protein  32.47 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0068  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3701  hypothetical protein  29.47 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0220  protein of unknown function DUF971  29.17 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.635086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3783  hypothetical protein  32.47 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0795  protein of unknown function DUF971  29.67 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.8673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1290  hypothetical protein  30.34 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0699  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  35.11 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0866  hypothetical protein  29.67 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.214574  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1315  hypothetical protein  27.84 
 
 
138 aa  48.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.1813  hitchhiker  0.00777852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5462  hypothetical protein  31.87 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271725  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  30.38 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4130  protein of unknown function DUF971  29.67 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3513  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0471  protein of unknown function DUF971  29.47 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3869  hypothetical protein  29.47 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1898  hypothetical protein  31.18 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.32912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0445  hypothetical protein  29.47 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0528  hypothetical protein  33.77 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0461  hypothetical protein  29.47 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1603  protein of unknown function DUF971  32.26 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2784  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.652126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2651  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624861  normal  0.511328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0457  hypothetical protein  32.47 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2024  protein of unknown function DUF971  27.96 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.09777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2699  heat shock protein DnaJ  28.89 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00021338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2121  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.59794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2733  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0780  hypothetical protein  29.87 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1309  hypothetical protein  32.14 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159335  hitchhiker  0.00415423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0566  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946647  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2760  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2761  hypothetical protein  28.71 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.255112  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2317  hypothetical protein  28.71 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.615217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0666  hypothetical protein  28.71 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0682  hypothetical protein  28.71 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2397  hypothetical protein  28.71 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2246  protein of unknown function DUF971  29.03 
 
 
125 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6060  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.961945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1580  hypothetical protein  26.88 
 
 
124 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253463  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10527  trimethyllysine dioxygenase TmlH, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06180)  40.38 
 
 
519 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.931626  normal  0.101484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  31.71 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0347  protein of unknown function DUF971  30.38 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.288464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4431  hypothetical protein  33.77 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.690938  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0859  hypothetical protein  29.87 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2940  hypothetical protein  30.34 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  34.07 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0373  hypothetical protein  32.47 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0332  protein of unknown function DUF971  29.87 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.591786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5002  hypothetical protein  28.12 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0395  hypothetical protein  27.85 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.185206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  34.12 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  31.46 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  41.46 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  28.12 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  32.26 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>