20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1801 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  34.39 
 
 		 187 aa  94.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  36.05 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  48.15 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  31.65 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  31.65 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  37.09 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  35.66 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  40.96 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  40 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  32.17 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  31.36 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  35.59 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0054  hypothetical protein  33.09 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0442309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  34 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  41.67 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  34.21 
 
 		 256 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1897  phage terminase small subunit  31.13 
 
 		 166 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  30.52 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  30.95 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>