More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0180 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  100 
 
 
87 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  78.05 
 
 
88 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  73.26 
 
 
87 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  72.73 
 
 
89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 
98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
100 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 
100 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 
95 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  75 
 
 
99 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  77.65 
 
 
86 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 
97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 
89 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  76.19 
 
 
85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  71.6 
 
 
92 aa  117  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
96 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
96 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  71.25 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
93 aa  114  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  71.43 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
93 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
94 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
94 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0700  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
83 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.987628  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 
93 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.52 
 
 
91 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
86 aa  110  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  66.27 
 
 
86 aa  110  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  67.07 
 
 
92 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
96 aa  110  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
94 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 
91 aa  110  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  69.88 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  73.17 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 
85 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 
88 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  66.67 
 
 
85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
95 aa  108  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  67.06 
 
 
84 aa  107  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
88 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  64.71 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl439  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 
95 aa  107  8.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  67.86 
 
 
85 aa  105  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  67.78 
 
 
88 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  65.52 
 
 
88 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  67.06 
 
 
86 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 
86 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1182  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
94 aa  105  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  65.43 
 
 
95 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 
90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  67.82 
 
 
90 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
82 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 
85 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 
89 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
84 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 
85 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 
85 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 
85 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  67.47 
 
 
90 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 
85 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  64.29 
 
 
93 aa  104  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 
87 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  66.67 
 
 
83 aa  104  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 
97 aa  104  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 
85 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 
86 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 
85 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>