175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3298 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2444  putative transposase, R6 like  69.4 
 
 		 504 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00883752  normal  0.351608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2559  putative transposase  69.4 
 
 		 504 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2706  putative transposase integrase, IstA  69.4 
 
 		 504 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3171  putative transposase integrase, R6-like  69.4 
 
 		 504 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.367303  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3751  hypothetical protein  69.4 
 
 		 504 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0125  integrase catalytic subunit  69.4 
 
 		 504 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5716  integrase catalytic region  69 
 
 		 504 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.400829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0461  integrase catalytic subunit  65.93 
 
 		 505 aa  661    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4732  integrase catalytic region  69 
 
 		 504 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6188  integrase catalytic region  69 
 
 		 504 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.244515 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5071  integrase catalytic subunit  73.4 
 
 		 500 aa  745    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5624  Integrase catalytic region  68.67 
 
 		 504 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186076 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3167  integrase catalytic subunit  96.86 
 
 		 509 aa  972    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.128774  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3221  integrase catalytic subunit  96.86 
 
 		 509 aa  972    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.70205  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3298  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 532 aa  1073    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3509  integrase catalytic subunit  98.87 
 
 		 532 aa  1062    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0082  transposase  51.1 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2667  putative transposase integrase protein  51.1 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1945  putative transposase  51.1 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359225  normal  0.0894285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0603  integrase catalytic subunit  53.86 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1002  integrase catalytic subunit  53.86 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00505393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3061  integrase catalytic subunit  53.86 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565322  normal  0.0599133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4490  integrase catalytic subunit  53.86 
 
 		 497 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.203803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1786  putative transposase  50.8 
 
 		 497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2703  transposase  46.09 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2028  Integrase catalytic region  45.47 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2401  Integrase catalytic region  45.47 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.918069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2776  Integrase catalytic region  45.47 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1516  Integrase catalytic region  45.47 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.985472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3177  ISAfe9, transposase  45.47 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4191  hypothetical protein  54.05 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02456  putative orphan protein; putative transposase  39.48 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0778  integrase catalytic subunit  39.31 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1256  integrase catalytic subunit  39.31 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2323  integrase catalytic subunit  39.31 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3547  integrase catalytic subunit  39.31 
 
 		 500 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4412  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0600  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0814  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1023  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1066  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1126  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1139  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1579  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1638  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1827  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1926  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2021  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2046  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2093  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2142  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0860562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2646  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2668  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2719  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2805  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2872  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2874  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.941214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3187  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3518  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3713  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3765  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3789  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3944  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4325  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4343  integrase catalytic subunit  39.11 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1330  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 		 488 aa  346  8e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4483  integrase, catalytic region  39.16 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.658405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0065  integrase catalytic subunit  39.12 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1623  integrase catalytic subunit  39.12 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4444  transposase  42.39 
 
 		 245 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5416  putative transposase  57.33 
 
 		 159 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3144  putative transposase  41.94 
 
 		 226 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4441  hypothetical protein  33.05 
 
 		 240 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  0.575803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3141  hypothetical protein  33.05 
 
 		 240 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5004  hypothetical protein  68 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3770  putative transposase  49.02 
 
 		 102 aa  93.6  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320441  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  28.76 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  28.76 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  28.76 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  28.76 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  25.6 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  25.73 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  25.73 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  27.12 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  26 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  24.33 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  27.8 
 
 		 584 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  28.81 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  22.53 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  22.53 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  22.53 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  22.53 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  24.37 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>