51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3271 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  192  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  96.97 
 
 		 99 aa  187  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  96.97 
 
 		 99 aa  187  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  48.39 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1648  helix-turn-helix protein, CopG  62.69 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519385  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  39.77 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  40.24 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  39.02 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  33.72 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  32.56 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  31.4 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  31.4 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  35.96 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  35.87 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  30.86 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  39.51 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  34.57 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  35.21 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  38.82 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  33.75 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  33.7 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  38.82 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  30.86 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  38.82 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  37.65 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  30.86 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  37.35 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  40.24 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  31.88 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  34.52 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  34.52 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  32.84 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  30 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  32.1 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  38.27 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  34.83 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  30.43 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  43.84 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  36.92 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  28.75 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  28.75 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  34.88 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  30.67 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  32.95 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  34.25 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  36.78 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>