77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1771 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  34.25 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  51.43 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  35.14 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  38.36 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  50 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  50 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  48.61 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  34.25 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  50.91 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  43.84 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  37.88 
 
 
796 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  36.49 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  36.49 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  35.14 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  36.99 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  35.62 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  43.14 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  46.43 
 
 
82 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  33.33 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  29.73 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  33.82 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  33.82 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  34.72 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  23.61 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  38.18 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  35.71 
 
 
77 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  38.6 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  34.78 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  22.22 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  22.22 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.73 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  44 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  33.33 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  33.78 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  36.84 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  28.38 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  33.93 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  32.05 
 
 
85 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  35.09 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  41.18 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  34.55 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  36.84 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  36.36 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  29.17 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  28.77 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2170  SirA family protein  33.33 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  28.79 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  39.13 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  36.21 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  29.17 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  25.71 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  36.84 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  39.62 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  31.58 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  29.41 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  31.67 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  25.71 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  27.78 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30.26 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1791  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1842  SirA family protein  31.34 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.483322  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1784  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2494  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.284005  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1828  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.263187  normal  0.225214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>