32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4035 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 254 aa  517  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  24.8 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  25.5 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 1979 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.41 
 
 		 668 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  25.2 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  24.41 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  29.61 
 
 		 784 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  29.23 
 
 		 682 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 581 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 477 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  23.6 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1094 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 533 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  23.2 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1827 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 740 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.53 
 
 		 929 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 1056 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.06 
 
 		 810 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  20.78 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.63 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 		 206 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 199 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 878 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>