More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2920 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  100 
 
 
126 aa  251  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  58.26 
 
 
119 aa  139  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  57.63 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  55.93 
 
 
120 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  54.24 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  53.39 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  55.46 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  53.39 
 
 
120 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  53.51 
 
 
123 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  52.94 
 
 
124 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  43.09 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.94 
 
 
129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
129 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 
124 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.21 
 
 
139 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  40.65 
 
 
129 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.65 
 
 
129 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  40.65 
 
 
129 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  40.65 
 
 
129 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  42.28 
 
 
132 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  38.52 
 
 
121 aa  104  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  38.52 
 
 
121 aa  103  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40.65 
 
 
126 aa  103  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
130 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
125 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
130 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  40.16 
 
 
130 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
127 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
127 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
126 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  100  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 
122 aa  99.4  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 
126 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 
128 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
126 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  39.02 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  44.35 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  38.21 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  38.21 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  36.59 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  37.4 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  35.48 
 
 
131 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  38.21 
 
 
130 aa  95.9  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  37.4 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.59 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  41.32 
 
 
298 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  38.21 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.59 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  34.96 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 
132 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
127 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 
129 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  37.5 
 
 
148 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  40.98 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  37.1 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  44.83 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  37.1 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3704  response regulator receiver domain-containing protein  39.2 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.600519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  35.77 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  36.29 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  37.9 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  35.77 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  35.77 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>