More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1231 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1231  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677961  hitchhiker  0.000900157 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  49.12 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  44.07 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  47.37 
 
 		 110 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  45.05 
 
 		 114 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 118 aa  95.5  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 110 aa  95.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  41.59 
 
 		 117 aa  95.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  45.22 
 
 		 111 aa  94.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  46.96 
 
 		 110 aa  94.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  46.09 
 
 		 111 aa  94.4  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 110 aa  94.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  38.94 
 
 		 122 aa  92.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 110 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  43.48 
 
 		 111 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  46.09 
 
 		 110 aa  92.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  42.98 
 
 		 117 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  40 
 
 		 113 aa  91.3  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  47.37 
 
 		 110 aa  91.7  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  46.09 
 
 		 110 aa  91.3  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 113 aa  91.3  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 111 aa  91.3  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 111 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  37.39 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  43.8 
 
 		 136 aa  90.5  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  38.05 
 
 		 121 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 		 110 aa  89.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 120 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  40.87 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  41.8 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  42.86 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 110 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  38.05 
 
 		 121 aa  89  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  43.93 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  46.96 
 
 		 110 aa  88.6  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  43.52 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  36.67 
 
 		 281 aa  88.6  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  43.86 
 
 		 112 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  38.71 
 
 		 126 aa  88.2  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 120 aa  87.8  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  37.5 
 
 		 123 aa  87.8  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  43.86 
 
 		 112 aa  87.8  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 111 aa  87.8  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1133  50S ribosomal protein L22  42.11 
 
 		 147 aa  87.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000462461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  42.11 
 
 		 111 aa  87.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  42.61 
 
 		 125 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  39.19 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  41.67 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  42.11 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  43.48 
 
 		 112 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 		 121 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  40.87 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  38.05 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  38.02 
 
 		 122 aa  85.1  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  38.52 
 
 		 140 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  41.74 
 
 		 110 aa  85.1  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  43.97 
 
 		 116 aa  85.1  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  43.36 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  44.25 
 
 		 113 aa  84.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  41.44 
 
 		 117 aa  84.7  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 110 aa  84.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  41.59 
 
 		 113 aa  84.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  44.74 
 
 		 110 aa  84.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 125 aa  84.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  44.35 
 
 		 110 aa  84.3  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 117 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  43.24 
 
 		 115 aa  84  9e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  40.19 
 
 		 158 aa  84  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  41.59 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  43.86 
 
 		 110 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  40.87 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  40.87 
 
 		 111 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  40.87 
 
 		 111 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  42.61 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3662  50S ribosomal protein L22  41.07 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  43.48 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  44.14 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  41.23 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>