More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1747 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1747  major facilitator transporter  100 
 
 
449 aa  849    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0505  major facilitator transporter  52.52 
 
 
437 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
452 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2556  major facilitator family transporter  41.42 
 
 
430 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2259  nitrite extrusion protein, putative  41.42 
 
 
430 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1586  major facilitator transporter  43.75 
 
 
448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0030166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  35.79 
 
 
417 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  32.85 
 
 
402 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  31.27 
 
 
441 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  36.07 
 
 
406 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  36.07 
 
 
406 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  36.07 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  30.02 
 
 
912 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  30.66 
 
 
905 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  28.98 
 
 
389 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.54 
 
 
387 aa  136  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.7 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.43 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  28.72 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  28.72 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  28.72 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  28.72 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.43 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  28.72 
 
 
389 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  34.69 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.28 
 
 
895 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  30.11 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  30.11 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  35.77 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  27.9 
 
 
424 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
444 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  32.21 
 
 
460 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  32.39 
 
 
403 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  31.38 
 
 
414 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.05 
 
 
389 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  34.91 
 
 
395 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  32.23 
 
 
403 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.85 
 
 
411 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
400 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  30.71 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  29.22 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  34.09 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
435 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  30.91 
 
 
404 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  31.03 
 
 
403 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.7 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 
403 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
421 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  34.32 
 
 
418 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  27.78 
 
 
425 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  33.33 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.87 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  27.87 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  28.26 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  27.63 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  28.64 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  31.23 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  30.48 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.82 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  30.33 
 
 
423 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0318  major facilitator transporter  33.33 
 
 
407 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  34.81 
 
 
399 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  31.27 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  32.8 
 
 
406 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  30.48 
 
 
431 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  30.23 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  31.54 
 
 
453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.23 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  26.73 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
438 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
438 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.12 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.12 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.12 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  33.85 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.12 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  28.14 
 
 
439 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
419 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  32.51 
 
 
403 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  29.93 
 
 
437 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  33.24 
 
 
403 aa  113  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.42 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  33.06 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  28.57 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  33.67 
 
 
893 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  33.15 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
421 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  33.06 
 
 
411 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>